Protein–RNA interactions for Protein: Q02878

RPL6, 60S ribosomal protein L6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL6Q02878 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPL6Q02878 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPL6Q02878 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPL6Q02878 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPL6Q02878 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPL6Q02878 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RPL6Q02878 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RPL6Q02878 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RPL6Q02878 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RPL6Q02878 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RPL6Q02878 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RPL6Q02878 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RPL6Q02878 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
RPL6Q02878 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RPL6Q02878 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RPL6Q02878 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RPL6Q02878 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
RPL6Q02878 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RPL6Q02878 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RPL6Q02878 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RPL6Q02878 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RPL6Q02878 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RPL6Q02878 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RPL6Q02878 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RPL6Q02878 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RPL6Q02878 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPL6Q02878 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPL6Q02878 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPL6Q02878 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPL6Q02878 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPL6Q02878 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
RPL6Q02878 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPL6Q02878 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPL6Q02878 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPL6Q02878 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPL6Q02878 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPL6Q02878 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
RPL6Q02878 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPL6Q02878 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPL6Q02878 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPL6Q02878 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPL6Q02878 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPL6Q02878 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
RPL6Q02878 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPL6Q02878 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPL6Q02878 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
RPL6Q02878 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
RPL6Q02878 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
RPL6Q02878 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPL6Q02878 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPL6Q02878 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPL6Q02878 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
RPL6Q02878 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPL6Q02878 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPL6Q02878 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPL6Q02878 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPL6Q02878 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPL6Q02878 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPL6Q02878 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
RPL6Q02878 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPL6Q02878 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPL6Q02878 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
RPL6Q02878 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPL6Q02878 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPL6Q02878 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPL6Q02878 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPL6Q02878 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPL6Q02878 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
RPL6Q02878 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPL6Q02878 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPL6Q02878 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPL6Q02878 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPL6Q02878 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
RPL6Q02878 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPL6Q02878 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPL6Q02878 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPL6Q02878 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPL6Q02878 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPL6Q02878 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPL6Q02878 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPL6Q02878 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPL6Q02878 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPL6Q02878 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPL6Q02878 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPL6Q02878 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPL6Q02878 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPL6Q02878 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPL6Q02878 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPL6Q02878 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RPL6Q02878 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RPL6Q02878 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
RPL6Q02878 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RPL6Q02878 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RPL6Q02878 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RPL6Q02878 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RPL6Q02878 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RPL6Q02878 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RPL6Q02878 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
RPL6Q02878 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
RPL6Q02878 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms