Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
DSG1Q02413 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
DSG1Q02413 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DSG1Q02413 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC21■□□□□ 0.95
DSG1Q02413 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DSG1Q02413 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DSG1Q02413 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DSG1Q02413 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DSG1Q02413 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
DSG1Q02413 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DSG1Q02413 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DSG1Q02413 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DSG1Q02413 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DSG1Q02413 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DSG1Q02413 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DSG1Q02413 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
DSG1Q02413 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
DSG1Q02413 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
DSG1Q02413 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
DSG1Q02413 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
DSG1Q02413 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
DSG1Q02413 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
DSG1Q02413 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
DSG1Q02413 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DSG1Q02413 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DSG1Q02413 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
DSG1Q02413 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DSG1Q02413 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
DSG1Q02413 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DSG1Q02413 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DSG1Q02413 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
DSG1Q02413 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DSG1Q02413 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DSG1Q02413 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DSG1Q02413 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
DSG1Q02413 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DSG1Q02413 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DSG1Q02413 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
DSG1Q02413 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
DSG1Q02413 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
DSG1Q02413 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DSG1Q02413 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DSG1Q02413 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DSG1Q02413 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
DSG1Q02413 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
DSG1Q02413 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
DSG1Q02413 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DSG1Q02413 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DSG1Q02413 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DSG1Q02413 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
DSG1Q02413 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
DSG1Q02413 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DSG1Q02413 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
DSG1Q02413 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DSG1Q02413 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DSG1Q02413 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
DSG1Q02413 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DSG1Q02413 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
DSG1Q02413 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
DSG1Q02413 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
DSG1Q02413 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
DSG1Q02413 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DSG1Q02413 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DSG1Q02413 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
DSG1Q02413 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
DSG1Q02413 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DSG1Q02413 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
DSG1Q02413 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
DSG1Q02413 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DSG1Q02413 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DSG1Q02413 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
DSG1Q02413 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
DSG1Q02413 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
DSG1Q02413 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
DSG1Q02413 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
DSG1Q02413 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DSG1Q02413 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DSG1Q02413 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DSG1Q02413 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DSG1Q02413 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
DSG1Q02413 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DSG1Q02413 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DSG1Q02413 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
DSG1Q02413 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
DSG1Q02413 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
DSG1Q02413 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
DSG1Q02413 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
DSG1Q02413 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
DSG1Q02413 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
DSG1Q02413 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
DSG1Q02413 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
DSG1Q02413 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DSG1Q02413 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
DSG1Q02413 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DSG1Q02413 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
DSG1Q02413 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
DSG1Q02413 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
DSG1Q02413 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
DSG1Q02413 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
DSG1Q02413 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms