Protein–RNA interactions for Protein: Q02246

CNTN2, Contactin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN2Q02246 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNTN2Q02246 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNTN2Q02246 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNTN2Q02246 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNTN2Q02246 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNTN2Q02246 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNTN2Q02246 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNTN2Q02246 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNTN2Q02246 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNTN2Q02246 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNTN2Q02246 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNTN2Q02246 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNTN2Q02246 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNTN2Q02246 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNTN2Q02246 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNTN2Q02246 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CNTN2Q02246 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNTN2Q02246 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNTN2Q02246 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNTN2Q02246 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNTN2Q02246 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNTN2Q02246 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNTN2Q02246 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNTN2Q02246 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNTN2Q02246 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNTN2Q02246 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNTN2Q02246 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNTN2Q02246 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNTN2Q02246 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNTN2Q02246 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNTN2Q02246 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNTN2Q02246 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNTN2Q02246 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNTN2Q02246 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNTN2Q02246 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNTN2Q02246 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNTN2Q02246 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNTN2Q02246 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNTN2Q02246 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNTN2Q02246 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNTN2Q02246 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNTN2Q02246 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNTN2Q02246 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNTN2Q02246 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTN2Q02246 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTN2Q02246 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTN2Q02246 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTN2Q02246 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTN2Q02246 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTN2Q02246 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTN2Q02246 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTN2Q02246 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTN2Q02246 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTN2Q02246 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTN2Q02246 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTN2Q02246 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTN2Q02246 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTN2Q02246 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTN2Q02246 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTN2Q02246 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTN2Q02246 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTN2Q02246 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTN2Q02246 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTN2Q02246 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTN2Q02246 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTN2Q02246 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTN2Q02246 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CNTN2Q02246 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CNTN2Q02246 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CNTN2Q02246 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTN2Q02246 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTN2Q02246 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTN2Q02246 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTN2Q02246 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTN2Q02246 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTN2Q02246 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTN2Q02246 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTN2Q02246 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTN2Q02246 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTN2Q02246 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTN2Q02246 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTN2Q02246 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTN2Q02246 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTN2Q02246 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTN2Q02246 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTN2Q02246 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTN2Q02246 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTN2Q02246 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTN2Q02246 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTN2Q02246 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTN2Q02246 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTN2Q02246 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTN2Q02246 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTN2Q02246 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTN2Q02246 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTN2Q02246 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTN2Q02246 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTN2Q02246 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTN2Q02246 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTN2Q02246 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms