Protein–RNA interactions for Protein: Q01970

PLCB3, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLCB3Q01970 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
PLCB3Q01970 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PLCB3Q01970 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PLCB3Q01970 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PLCB3Q01970 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PLCB3Q01970 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PLCB3Q01970 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PLCB3Q01970 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PLCB3Q01970 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PLCB3Q01970 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PLCB3Q01970 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PLCB3Q01970 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PLCB3Q01970 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PLCB3Q01970 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PLCB3Q01970 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PLCB3Q01970 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PLCB3Q01970 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PLCB3Q01970 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PLCB3Q01970 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PLCB3Q01970 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PLCB3Q01970 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PLCB3Q01970 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PLCB3Q01970 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PLCB3Q01970 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PLCB3Q01970 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PLCB3Q01970 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PLCB3Q01970 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PLCB3Q01970 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PLCB3Q01970 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PLCB3Q01970 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PLCB3Q01970 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PLCB3Q01970 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PLCB3Q01970 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PLCB3Q01970 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PLCB3Q01970 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PLCB3Q01970 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PLCB3Q01970 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PLCB3Q01970 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PLCB3Q01970 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PLCB3Q01970 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PLCB3Q01970 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PLCB3Q01970 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PLCB3Q01970 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PLCB3Q01970 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PLCB3Q01970 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PLCB3Q01970 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PLCB3Q01970 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PLCB3Q01970 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PLCB3Q01970 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PLCB3Q01970 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PLCB3Q01970 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PLCB3Q01970 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PLCB3Q01970 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PLCB3Q01970 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PLCB3Q01970 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PLCB3Q01970 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PLCB3Q01970 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PLCB3Q01970 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PLCB3Q01970 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PLCB3Q01970 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PLCB3Q01970 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PLCB3Q01970 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PLCB3Q01970 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PLCB3Q01970 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PLCB3Q01970 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PLCB3Q01970 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PLCB3Q01970 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PLCB3Q01970 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PLCB3Q01970 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PLCB3Q01970 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PLCB3Q01970 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PLCB3Q01970 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PLCB3Q01970 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PLCB3Q01970 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PLCB3Q01970 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PLCB3Q01970 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PLCB3Q01970 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PLCB3Q01970 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PLCB3Q01970 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PLCB3Q01970 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PLCB3Q01970 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PLCB3Q01970 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PLCB3Q01970 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PLCB3Q01970 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PLCB3Q01970 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PLCB3Q01970 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PLCB3Q01970 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PLCB3Q01970 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PLCB3Q01970 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PLCB3Q01970 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PLCB3Q01970 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PLCB3Q01970 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PLCB3Q01970 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PLCB3Q01970 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PLCB3Q01970 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PLCB3Q01970 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PLCB3Q01970 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PLCB3Q01970 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PLCB3Q01970 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PLCB3Q01970 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms