Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC16■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms