Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDK16Q00536 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDK16Q00536 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDK16Q00536 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDK16Q00536 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDK16Q00536 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDK16Q00536 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDK16Q00536 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDK16Q00536 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDK16Q00536 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDK16Q00536 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDK16Q00536 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CDK16Q00536 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDK16Q00536 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CDK16Q00536 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDK16Q00536 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CDK16Q00536 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDK16Q00536 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDK16Q00536 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDK16Q00536 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDK16Q00536 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDK16Q00536 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDK16Q00536 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDK16Q00536 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDK16Q00536 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDK16Q00536 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDK16Q00536 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDK16Q00536 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDK16Q00536 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDK16Q00536 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDK16Q00536 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDK16Q00536 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CDK16Q00536 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDK16Q00536 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDK16Q00536 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDK16Q00536 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDK16Q00536 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDK16Q00536 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDK16Q00536 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDK16Q00536 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDK16Q00536 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDK16Q00536 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDK16Q00536 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDK16Q00536 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDK16Q00536 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDK16Q00536 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDK16Q00536 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDK16Q00536 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDK16Q00536 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDK16Q00536 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDK16Q00536 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDK16Q00536 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDK16Q00536 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDK16Q00536 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDK16Q00536 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CDK16Q00536 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDK16Q00536 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDK16Q00536 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDK16Q00536 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDK16Q00536 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDK16Q00536 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CDK16Q00536 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDK16Q00536 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDK16Q00536 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDK16Q00536 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDK16Q00536 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CDK16Q00536 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDK16Q00536 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDK16Q00536 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDK16Q00536 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDK16Q00536 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDK16Q00536 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDK16Q00536 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDK16Q00536 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDK16Q00536 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDK16Q00536 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDK16Q00536 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDK16Q00536 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDK16Q00536 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CDK16Q00536 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDK16Q00536 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDK16Q00536 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDK16Q00536 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDK16Q00536 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDK16Q00536 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDK16Q00536 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDK16Q00536 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDK16Q00536 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDK16Q00536 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDK16Q00536 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDK16Q00536 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDK16Q00536 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDK16Q00536 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDK16Q00536 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDK16Q00536 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CDK16Q00536 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDK16Q00536 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDK16Q00536 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDK16Q00536 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDK16Q00536 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms