Protein–RNA interactions for Protein: P78312

FAM193A, Protein FAM193A, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM193AP78312 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM193AP78312 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM193AP78312 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM193AP78312 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM193AP78312 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM193AP78312 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM193AP78312 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM193AP78312 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM193AP78312 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM193AP78312 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM193AP78312 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM193AP78312 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM193AP78312 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM193AP78312 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM193AP78312 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM193AP78312 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM193AP78312 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM193AP78312 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM193AP78312 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM193AP78312 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM193AP78312 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM193AP78312 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM193AP78312 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM193AP78312 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM193AP78312 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM193AP78312 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM193AP78312 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM193AP78312 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM193AP78312 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM193AP78312 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM193AP78312 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM193AP78312 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM193AP78312 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM193AP78312 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM193AP78312 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM193AP78312 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM193AP78312 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM193AP78312 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM193AP78312 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM193AP78312 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM193AP78312 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM193AP78312 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM193AP78312 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM193AP78312 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM193AP78312 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM193AP78312 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM193AP78312 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM193AP78312 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM193AP78312 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM193AP78312 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM193AP78312 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM193AP78312 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM193AP78312 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM193AP78312 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM193AP78312 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM193AP78312 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM193AP78312 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM193AP78312 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM193AP78312 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM193AP78312 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM193AP78312 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM193AP78312 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM193AP78312 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM193AP78312 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM193AP78312 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM193AP78312 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM193AP78312 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM193AP78312 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM193AP78312 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM193AP78312 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM193AP78312 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM193AP78312 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM193AP78312 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM193AP78312 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM193AP78312 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM193AP78312 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM193AP78312 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM193AP78312 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM193AP78312 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM193AP78312 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM193AP78312 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM193AP78312 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM193AP78312 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM193AP78312 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM193AP78312 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM193AP78312 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM193AP78312 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM193AP78312 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM193AP78312 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM193AP78312 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM193AP78312 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM193AP78312 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM193AP78312 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM193AP78312 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM193AP78312 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM193AP78312 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM193AP78312 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM193AP78312 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM193AP78312 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM193AP78312 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms