Protein–RNA interactions for Protein: P63261

ACTG1, Actin, cytoplasmic 2, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTG1P63261 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACTG1P63261 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ACTG1P63261 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACTG1P63261 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTG1P63261 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTG1P63261 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTG1P63261 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTG1P63261 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTG1P63261 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTG1P63261 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTG1P63261 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTG1P63261 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTG1P63261 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTG1P63261 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTG1P63261 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTG1P63261 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTG1P63261 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTG1P63261 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTG1P63261 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTG1P63261 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTG1P63261 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTG1P63261 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTG1P63261 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTG1P63261 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTG1P63261 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTG1P63261 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTG1P63261 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTG1P63261 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTG1P63261 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTG1P63261 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTG1P63261 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTG1P63261 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTG1P63261 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTG1P63261 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTG1P63261 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTG1P63261 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ACTG1P63261 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ACTG1P63261 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ACTG1P63261 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ACTG1P63261 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ACTG1P63261 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ACTG1P63261 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ACTG1P63261 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ACTG1P63261 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ACTG1P63261 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
ACTG1P63261 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTG1P63261 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTG1P63261 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTG1P63261 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTG1P63261 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTG1P63261 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTG1P63261 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTG1P63261 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTG1P63261 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTG1P63261 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTG1P63261 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTG1P63261 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTG1P63261 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTG1P63261 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTG1P63261 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTG1P63261 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTG1P63261 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTG1P63261 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTG1P63261 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTG1P63261 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTG1P63261 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTG1P63261 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTG1P63261 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTG1P63261 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTG1P63261 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTG1P63261 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTG1P63261 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTG1P63261 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTG1P63261 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTG1P63261 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTG1P63261 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTG1P63261 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTG1P63261 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTG1P63261 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTG1P63261 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTG1P63261 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTG1P63261 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTG1P63261 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACTG1P63261 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACTG1P63261 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACTG1P63261 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACTG1P63261 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACTG1P63261 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACTG1P63261 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACTG1P63261 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACTG1P63261 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACTG1P63261 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACTG1P63261 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACTG1P63261 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACTG1P63261 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACTG1P63261 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACTG1P63261 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACTG1P63261 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACTG1P63261 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ACTG1P63261 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms