Protein–RNA interactions for Protein: P63145

ERVK-24, Endogenous retrovirus group K member 24 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-24P63145 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERVK-24P63145 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERVK-24P63145 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERVK-24P63145 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ERVK-24P63145 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERVK-24P63145 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERVK-24P63145 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERVK-24P63145 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERVK-24P63145 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERVK-24P63145 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERVK-24P63145 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERVK-24P63145 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERVK-24P63145 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ERVK-24P63145 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERVK-24P63145 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ERVK-24P63145 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERVK-24P63145 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERVK-24P63145 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERVK-24P63145 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERVK-24P63145 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERVK-24P63145 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERVK-24P63145 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERVK-24P63145 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERVK-24P63145 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERVK-24P63145 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERVK-24P63145 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERVK-24P63145 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERVK-24P63145 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERVK-24P63145 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERVK-24P63145 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERVK-24P63145 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERVK-24P63145 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERVK-24P63145 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERVK-24P63145 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERVK-24P63145 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
ERVK-24P63145 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
ERVK-24P63145 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERVK-24P63145 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERVK-24P63145 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERVK-24P63145 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERVK-24P63145 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERVK-24P63145 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERVK-24P63145 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERVK-24P63145 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ERVK-24P63145 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ERVK-24P63145 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERVK-24P63145 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERVK-24P63145 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ERVK-24P63145 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERVK-24P63145 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERVK-24P63145 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERVK-24P63145 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERVK-24P63145 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERVK-24P63145 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ERVK-24P63145 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERVK-24P63145 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERVK-24P63145 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERVK-24P63145 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERVK-24P63145 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERVK-24P63145 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERVK-24P63145 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERVK-24P63145 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERVK-24P63145 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERVK-24P63145 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERVK-24P63145 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ERVK-24P63145 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERVK-24P63145 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERVK-24P63145 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ERVK-24P63145 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERVK-24P63145 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERVK-24P63145 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERVK-24P63145 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERVK-24P63145 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERVK-24P63145 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERVK-24P63145 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERVK-24P63145 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERVK-24P63145 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERVK-24P63145 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERVK-24P63145 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERVK-24P63145 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERVK-24P63145 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERVK-24P63145 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERVK-24P63145 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERVK-24P63145 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ERVK-24P63145 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERVK-24P63145 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ERVK-24P63145 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERVK-24P63145 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERVK-24P63145 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERVK-24P63145 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERVK-24P63145 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERVK-24P63145 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERVK-24P63145 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERVK-24P63145 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERVK-24P63145 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERVK-24P63145 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERVK-24P63145 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERVK-24P63145 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERVK-24P63145 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERVK-24P63145 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms