Protein–RNA interactions for Protein: P61009

SPCS3, Signal peptidase complex subunit 3, humanhuman

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Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS3P61009 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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