Protein–RNA interactions for Protein: P58215

LOXL3, Lysyl oxidase homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL3P58215 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LOXL3P58215 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LOXL3P58215 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LOXL3P58215 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LOXL3P58215 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LOXL3P58215 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LOXL3P58215 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LOXL3P58215 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LOXL3P58215 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LOXL3P58215 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LOXL3P58215 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LOXL3P58215 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LOXL3P58215 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LOXL3P58215 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LOXL3P58215 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LOXL3P58215 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LOXL3P58215 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LOXL3P58215 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LOXL3P58215 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LOXL3P58215 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LOXL3P58215 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LOXL3P58215 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
LOXL3P58215 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LOXL3P58215 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LOXL3P58215 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
LOXL3P58215 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
LOXL3P58215 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LOXL3P58215 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LOXL3P58215 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LOXL3P58215 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LOXL3P58215 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LOXL3P58215 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LOXL3P58215 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LOXL3P58215 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LOXL3P58215 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LOXL3P58215 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LOXL3P58215 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LOXL3P58215 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms