Protein–RNA interactions for Protein: P56545

CTBP2, C-terminal-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP2P56545 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTBP2P56545 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTBP2P56545 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTBP2P56545 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTBP2P56545 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTBP2P56545 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTBP2P56545 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTBP2P56545 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTBP2P56545 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTBP2P56545 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTBP2P56545 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTBP2P56545 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTBP2P56545 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTBP2P56545 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTBP2P56545 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTBP2P56545 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTBP2P56545 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTBP2P56545 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTBP2P56545 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTBP2P56545 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTBP2P56545 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTBP2P56545 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTBP2P56545 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CTBP2P56545 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTBP2P56545 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTBP2P56545 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTBP2P56545 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTBP2P56545 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTBP2P56545 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTBP2P56545 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTBP2P56545 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTBP2P56545 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CTBP2P56545 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CTBP2P56545 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTBP2P56545 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTBP2P56545 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTBP2P56545 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTBP2P56545 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTBP2P56545 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTBP2P56545 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTBP2P56545 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTBP2P56545 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTBP2P56545 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTBP2P56545 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTBP2P56545 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTBP2P56545 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTBP2P56545 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTBP2P56545 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTBP2P56545 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTBP2P56545 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTBP2P56545 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTBP2P56545 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTBP2P56545 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTBP2P56545 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTBP2P56545 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTBP2P56545 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTBP2P56545 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTBP2P56545 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CTBP2P56545 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTBP2P56545 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTBP2P56545 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CTBP2P56545 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CTBP2P56545 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTBP2P56545 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTBP2P56545 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTBP2P56545 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTBP2P56545 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTBP2P56545 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTBP2P56545 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTBP2P56545 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTBP2P56545 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTBP2P56545 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTBP2P56545 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTBP2P56545 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTBP2P56545 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTBP2P56545 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTBP2P56545 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTBP2P56545 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTBP2P56545 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTBP2P56545 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTBP2P56545 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTBP2P56545 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTBP2P56545 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTBP2P56545 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTBP2P56545 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTBP2P56545 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTBP2P56545 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTBP2P56545 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTBP2P56545 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTBP2P56545 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTBP2P56545 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTBP2P56545 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTBP2P56545 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTBP2P56545 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTBP2P56545 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTBP2P56545 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTBP2P56545 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTBP2P56545 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTBP2P56545 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CTBP2P56545 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms