Protein–RNA interactions for Protein: P56159

GFRA1, GDNF family receptor alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA1P56159 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GFRA1P56159 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GFRA1P56159 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GFRA1P56159 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GFRA1P56159 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GFRA1P56159 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GFRA1P56159 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GFRA1P56159 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GFRA1P56159 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GFRA1P56159 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GFRA1P56159 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GFRA1P56159 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GFRA1P56159 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GFRA1P56159 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GFRA1P56159 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GFRA1P56159 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GFRA1P56159 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GFRA1P56159 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GFRA1P56159 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GFRA1P56159 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GFRA1P56159 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GFRA1P56159 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GFRA1P56159 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GFRA1P56159 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GFRA1P56159 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GFRA1P56159 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GFRA1P56159 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GFRA1P56159 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GFRA1P56159 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GFRA1P56159 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GFRA1P56159 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GFRA1P56159 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GFRA1P56159 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GFRA1P56159 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GFRA1P56159 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GFRA1P56159 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GFRA1P56159 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GFRA1P56159 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GFRA1P56159 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GFRA1P56159 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GFRA1P56159 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GFRA1P56159 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GFRA1P56159 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GFRA1P56159 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GFRA1P56159 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GFRA1P56159 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GFRA1P56159 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GFRA1P56159 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
GFRA1P56159 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
GFRA1P56159 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GFRA1P56159 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GFRA1P56159 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GFRA1P56159 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
GFRA1P56159 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
GFRA1P56159 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
GFRA1P56159 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GFRA1P56159 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GFRA1P56159 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GFRA1P56159 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GFRA1P56159 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GFRA1P56159 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GFRA1P56159 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GFRA1P56159 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GFRA1P56159 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GFRA1P56159 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GFRA1P56159 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GFRA1P56159 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GFRA1P56159 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GFRA1P56159 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GFRA1P56159 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GFRA1P56159 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GFRA1P56159 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GFRA1P56159 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GFRA1P56159 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GFRA1P56159 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
GFRA1P56159 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GFRA1P56159 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GFRA1P56159 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GFRA1P56159 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GFRA1P56159 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GFRA1P56159 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GFRA1P56159 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GFRA1P56159 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GFRA1P56159 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GFRA1P56159 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GFRA1P56159 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GFRA1P56159 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GFRA1P56159 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GFRA1P56159 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GFRA1P56159 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GFRA1P56159 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GFRA1P56159 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GFRA1P56159 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GFRA1P56159 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GFRA1P56159 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GFRA1P56159 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GFRA1P56159 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GFRA1P56159 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GFRA1P56159 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GFRA1P56159 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms