Protein–RNA interactions for Protein: P54920

NAPA, Alpha-soluble NSF attachment protein, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAPAP54920 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NAPAP54920 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NAPAP54920 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NAPAP54920 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NAPAP54920 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NAPAP54920 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NAPAP54920 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NAPAP54920 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NAPAP54920 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NAPAP54920 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NAPAP54920 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NAPAP54920 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NAPAP54920 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NAPAP54920 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NAPAP54920 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NAPAP54920 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NAPAP54920 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NAPAP54920 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NAPAP54920 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NAPAP54920 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NAPAP54920 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NAPAP54920 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NAPAP54920 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NAPAP54920 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NAPAP54920 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NAPAP54920 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NAPAP54920 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NAPAP54920 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NAPAP54920 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NAPAP54920 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NAPAP54920 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NAPAP54920 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NAPAP54920 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NAPAP54920 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NAPAP54920 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NAPAP54920 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NAPAP54920 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NAPAP54920 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NAPAP54920 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NAPAP54920 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NAPAP54920 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NAPAP54920 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NAPAP54920 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NAPAP54920 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NAPAP54920 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NAPAP54920 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NAPAP54920 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NAPAP54920 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NAPAP54920 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NAPAP54920 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NAPAP54920 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NAPAP54920 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NAPAP54920 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NAPAP54920 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NAPAP54920 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NAPAP54920 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NAPAP54920 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NAPAP54920 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NAPAP54920 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NAPAP54920 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NAPAP54920 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NAPAP54920 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NAPAP54920 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NAPAP54920 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NAPAP54920 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NAPAP54920 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NAPAP54920 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NAPAP54920 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NAPAP54920 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NAPAP54920 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NAPAP54920 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NAPAP54920 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NAPAP54920 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NAPAP54920 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NAPAP54920 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NAPAP54920 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NAPAP54920 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NAPAP54920 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NAPAP54920 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NAPAP54920 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NAPAP54920 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NAPAP54920 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NAPAP54920 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NAPAP54920 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NAPAP54920 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NAPAP54920 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NAPAP54920 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NAPAP54920 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NAPAP54920 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NAPAP54920 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NAPAP54920 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NAPAP54920 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NAPAP54920 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NAPAP54920 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NAPAP54920 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NAPAP54920 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NAPAP54920 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NAPAP54920 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NAPAP54920 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NAPAP54920 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms