Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms