Protein–RNA interactions for Protein: P52954

LBX1, Transcription factor LBX1, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LBX1P52954 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LBX1P52954 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LBX1P52954 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LBX1P52954 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LBX1P52954 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LBX1P52954 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LBX1P52954 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LBX1P52954 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LBX1P52954 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LBX1P52954 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LBX1P52954 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LBX1P52954 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LBX1P52954 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LBX1P52954 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LBX1P52954 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LBX1P52954 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LBX1P52954 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LBX1P52954 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LBX1P52954 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LBX1P52954 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LBX1P52954 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LBX1P52954 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LBX1P52954 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LBX1P52954 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LBX1P52954 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LBX1P52954 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LBX1P52954 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LBX1P52954 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LBX1P52954 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LBX1P52954 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LBX1P52954 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LBX1P52954 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LBX1P52954 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LBX1P52954 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LBX1P52954 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LBX1P52954 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LBX1P52954 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LBX1P52954 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LBX1P52954 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LBX1P52954 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LBX1P52954 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LBX1P52954 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LBX1P52954 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LBX1P52954 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LBX1P52954 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LBX1P52954 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LBX1P52954 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LBX1P52954 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LBX1P52954 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LBX1P52954 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LBX1P52954 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LBX1P52954 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LBX1P52954 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LBX1P52954 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LBX1P52954 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LBX1P52954 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LBX1P52954 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LBX1P52954 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LBX1P52954 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LBX1P52954 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LBX1P52954 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LBX1P52954 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LBX1P52954 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LBX1P52954 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LBX1P52954 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LBX1P52954 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
LBX1P52954 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LBX1P52954 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LBX1P52954 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LBX1P52954 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
LBX1P52954 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LBX1P52954 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
LBX1P52954 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LBX1P52954 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LBX1P52954 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LBX1P52954 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LBX1P52954 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LBX1P52954 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LBX1P52954 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LBX1P52954 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LBX1P52954 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LBX1P52954 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LBX1P52954 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LBX1P52954 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LBX1P52954 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LBX1P52954 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LBX1P52954 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LBX1P52954 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LBX1P52954 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
LBX1P52954 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LBX1P52954 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LBX1P52954 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LBX1P52954 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LBX1P52954 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LBX1P52954 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LBX1P52954 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LBX1P52954 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LBX1P52954 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LBX1P52954 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LBX1P52954 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms