Protein–RNA interactions for Protein: P52742

ZNF135, Zinc finger protein 135, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF135P52742 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF135P52742 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF135P52742 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF135P52742 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF135P52742 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF135P52742 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF135P52742 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF135P52742 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF135P52742 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF135P52742 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF135P52742 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF135P52742 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF135P52742 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF135P52742 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF135P52742 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF135P52742 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF135P52742 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF135P52742 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF135P52742 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF135P52742 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF135P52742 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF135P52742 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF135P52742 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF135P52742 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF135P52742 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF135P52742 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF135P52742 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF135P52742 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF135P52742 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF135P52742 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF135P52742 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF135P52742 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF135P52742 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF135P52742 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF135P52742 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF135P52742 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF135P52742 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF135P52742 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF135P52742 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF135P52742 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF135P52742 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF135P52742 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF135P52742 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF135P52742 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF135P52742 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF135P52742 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF135P52742 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF135P52742 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF135P52742 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF135P52742 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF135P52742 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF135P52742 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF135P52742 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF135P52742 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF135P52742 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF135P52742 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF135P52742 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF135P52742 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF135P52742 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF135P52742 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF135P52742 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF135P52742 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF135P52742 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF135P52742 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF135P52742 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF135P52742 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF135P52742 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF135P52742 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF135P52742 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF135P52742 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF135P52742 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF135P52742 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF135P52742 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF135P52742 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF135P52742 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF135P52742 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF135P52742 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF135P52742 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF135P52742 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF135P52742 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF135P52742 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF135P52742 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF135P52742 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF135P52742 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF135P52742 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF135P52742 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF135P52742 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF135P52742 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF135P52742 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF135P52742 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF135P52742 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF135P52742 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF135P52742 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF135P52742 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF135P52742 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF135P52742 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF135P52742 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF135P52742 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF135P52742 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF135P52742 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms