Protein–RNA interactions for Protein: P51787

KCNQ1, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 1, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1P51787 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
KCNQ1P51787 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KCNQ1P51787 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KCNQ1P51787 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KCNQ1P51787 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KCNQ1P51787 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KCNQ1P51787 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KCNQ1P51787 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
KCNQ1P51787 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KCNQ1P51787 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KCNQ1P51787 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KCNQ1P51787 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KCNQ1P51787 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KCNQ1P51787 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KCNQ1P51787 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KCNQ1P51787 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KCNQ1P51787 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
KCNQ1P51787 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KCNQ1P51787 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KCNQ1P51787 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KCNQ1P51787 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KCNQ1P51787 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KCNQ1P51787 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KCNQ1P51787 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KCNQ1P51787 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KCNQ1P51787 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KCNQ1P51787 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KCNQ1P51787 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KCNQ1P51787 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KCNQ1P51787 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KCNQ1P51787 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KCNQ1P51787 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KCNQ1P51787 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KCNQ1P51787 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KCNQ1P51787 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KCNQ1P51787 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KCNQ1P51787 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KCNQ1P51787 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KCNQ1P51787 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KCNQ1P51787 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KCNQ1P51787 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KCNQ1P51787 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KCNQ1P51787 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KCNQ1P51787 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
KCNQ1P51787 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KCNQ1P51787 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KCNQ1P51787 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KCNQ1P51787 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KCNQ1P51787 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KCNQ1P51787 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KCNQ1P51787 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KCNQ1P51787 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KCNQ1P51787 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KCNQ1P51787 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KCNQ1P51787 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KCNQ1P51787 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KCNQ1P51787 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KCNQ1P51787 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KCNQ1P51787 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KCNQ1P51787 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KCNQ1P51787 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KCNQ1P51787 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KCNQ1P51787 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
KCNQ1P51787 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KCNQ1P51787 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KCNQ1P51787 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KCNQ1P51787 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KCNQ1P51787 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KCNQ1P51787 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KCNQ1P51787 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KCNQ1P51787 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KCNQ1P51787 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
KCNQ1P51787 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KCNQ1P51787 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KCNQ1P51787 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KCNQ1P51787 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KCNQ1P51787 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KCNQ1P51787 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KCNQ1P51787 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KCNQ1P51787 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KCNQ1P51787 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KCNQ1P51787 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KCNQ1P51787 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KCNQ1P51787 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KCNQ1P51787 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KCNQ1P51787 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KCNQ1P51787 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KCNQ1P51787 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KCNQ1P51787 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KCNQ1P51787 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KCNQ1P51787 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KCNQ1P51787 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KCNQ1P51787 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
KCNQ1P51787 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
KCNQ1P51787 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
KCNQ1P51787 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.94
KCNQ1P51787 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
KCNQ1P51787 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
KCNQ1P51787 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
KCNQ1P51787 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms