Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSEN1P49768 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSEN1P49768 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSEN1P49768 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSEN1P49768 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSEN1P49768 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSEN1P49768 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSEN1P49768 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSEN1P49768 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSEN1P49768 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSEN1P49768 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSEN1P49768 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSEN1P49768 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSEN1P49768 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PSEN1P49768 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSEN1P49768 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSEN1P49768 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSEN1P49768 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSEN1P49768 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PSEN1P49768 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSEN1P49768 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSEN1P49768 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSEN1P49768 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSEN1P49768 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSEN1P49768 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSEN1P49768 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSEN1P49768 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSEN1P49768 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSEN1P49768 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSEN1P49768 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSEN1P49768 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSEN1P49768 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSEN1P49768 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSEN1P49768 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSEN1P49768 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSEN1P49768 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSEN1P49768 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSEN1P49768 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSEN1P49768 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSEN1P49768 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSEN1P49768 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSEN1P49768 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSEN1P49768 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSEN1P49768 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSEN1P49768 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PSEN1P49768 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PSEN1P49768 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
PSEN1P49768 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PSEN1P49768 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PSEN1P49768 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PSEN1P49768 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PSEN1P49768 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
PSEN1P49768 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PSEN1P49768 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PSEN1P49768 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PSEN1P49768 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PSEN1P49768 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PSEN1P49768 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PSEN1P49768 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PSEN1P49768 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PSEN1P49768 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PSEN1P49768 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PSEN1P49768 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PSEN1P49768 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PSEN1P49768 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSEN1P49768 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSEN1P49768 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSEN1P49768 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSEN1P49768 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSEN1P49768 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSEN1P49768 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSEN1P49768 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSEN1P49768 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSEN1P49768 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
PSEN1P49768 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSEN1P49768 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSEN1P49768 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSEN1P49768 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSEN1P49768 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSEN1P49768 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSEN1P49768 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSEN1P49768 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSEN1P49768 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSEN1P49768 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSEN1P49768 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSEN1P49768 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSEN1P49768 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSEN1P49768 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
PSEN1P49768 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSEN1P49768 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PSEN1P49768 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PSEN1P49768 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PSEN1P49768 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PSEN1P49768 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PSEN1P49768 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PSEN1P49768 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PSEN1P49768 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PSEN1P49768 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PSEN1P49768 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PSEN1P49768 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms