Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TTPAP49638 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TTPAP49638 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TTPAP49638 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TTPAP49638 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TTPAP49638 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TTPAP49638 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TTPAP49638 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TTPAP49638 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TTPAP49638 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TTPAP49638 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TTPAP49638 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TTPAP49638 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TTPAP49638 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TTPAP49638 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TTPAP49638 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TTPAP49638 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TTPAP49638 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TTPAP49638 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TTPAP49638 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TTPAP49638 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TTPAP49638 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TTPAP49638 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TTPAP49638 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TTPAP49638 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TTPAP49638 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TTPAP49638 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TTPAP49638 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TTPAP49638 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TTPAP49638 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TTPAP49638 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TTPAP49638 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TTPAP49638 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TTPAP49638 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TTPAP49638 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TTPAP49638 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TTPAP49638 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TTPAP49638 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TTPAP49638 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TTPAP49638 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TTPAP49638 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TTPAP49638 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TTPAP49638 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TTPAP49638 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TTPAP49638 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TTPAP49638 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TTPAP49638 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TTPAP49638 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TTPAP49638 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TTPAP49638 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TTPAP49638 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TTPAP49638 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TTPAP49638 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TTPAP49638 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TTPAP49638 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TTPAP49638 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TTPAP49638 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TTPAP49638 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TTPAP49638 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TTPAP49638 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TTPAP49638 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TTPAP49638 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TTPAP49638 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TTPAP49638 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TTPAP49638 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TTPAP49638 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TTPAP49638 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TTPAP49638 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TTPAP49638 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TTPAP49638 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TTPAP49638 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TTPAP49638 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TTPAP49638 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TTPAP49638 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TTPAP49638 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TTPAP49638 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TTPAP49638 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TTPAP49638 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TTPAP49638 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TTPAP49638 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TTPAP49638 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TTPAP49638 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TTPAP49638 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TTPAP49638 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TTPAP49638 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TTPAP49638 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TTPAP49638 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
TTPAP49638 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TTPAP49638 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TTPAP49638 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TTPAP49638 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TTPAP49638 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TTPAP49638 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TTPAP49638 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TTPAP49638 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TTPAP49638 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TTPAP49638 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TTPAP49638 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TTPAP49638 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TTPAP49638 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
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