Protein–RNA interactions for Protein: P49450

CENPA, Histone H3-like centromeric protein A, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPAP49450 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CENPAP49450 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CENPAP49450 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CENPAP49450 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CENPAP49450 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CENPAP49450 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CENPAP49450 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CENPAP49450 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CENPAP49450 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPAP49450 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPAP49450 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPAP49450 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPAP49450 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPAP49450 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPAP49450 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPAP49450 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPAP49450 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPAP49450 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPAP49450 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPAP49450 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPAP49450 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPAP49450 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPAP49450 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPAP49450 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPAP49450 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPAP49450 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPAP49450 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPAP49450 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPAP49450 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPAP49450 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPAP49450 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPAP49450 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPAP49450 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPAP49450 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPAP49450 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CENPAP49450 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CENPAP49450 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CENPAP49450 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CENPAP49450 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CENPAP49450 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CENPAP49450 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CENPAP49450 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CENPAP49450 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CENPAP49450 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CENPAP49450 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CENPAP49450 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CENPAP49450 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CENPAP49450 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CENPAP49450 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CENPAP49450 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CENPAP49450 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CENPAP49450 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CENPAP49450 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CENPAP49450 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CENPAP49450 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CENPAP49450 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CENPAP49450 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CENPAP49450 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CENPAP49450 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CENPAP49450 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CENPAP49450 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CENPAP49450 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CENPAP49450 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CENPAP49450 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CENPAP49450 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CENPAP49450 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CENPAP49450 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CENPAP49450 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CENPAP49450 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CENPAP49450 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CENPAP49450 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CENPAP49450 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CENPAP49450 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CENPAP49450 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CENPAP49450 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CENPAP49450 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CENPAP49450 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CENPAP49450 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CENPAP49450 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CENPAP49450 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CENPAP49450 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CENPAP49450 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CENPAP49450 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CENPAP49450 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CENPAP49450 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CENPAP49450 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CENPAP49450 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CENPAP49450 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CENPAP49450 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CENPAP49450 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CENPAP49450 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CENPAP49450 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CENPAP49450 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CENPAP49450 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CENPAP49450 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CENPAP49450 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CENPAP49450 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CENPAP49450 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CENPAP49450 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CENPAP49450 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms