Protein–RNA interactions for Protein: P49335

POU3F4, POU domain, class 3, transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU3F4P49335 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POU3F4P49335 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POU3F4P49335 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POU3F4P49335 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POU3F4P49335 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POU3F4P49335 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POU3F4P49335 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POU3F4P49335 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POU3F4P49335 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POU3F4P49335 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POU3F4P49335 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POU3F4P49335 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
POU3F4P49335 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POU3F4P49335 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POU3F4P49335 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.34
POU3F4P49335 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
POU3F4P49335 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
POU3F4P49335 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POU3F4P49335 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms