Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MCAMP43121 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MCAMP43121 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MCAMP43121 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
MCAMP43121 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
MCAMP43121 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
MCAMP43121 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MCAMP43121 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MCAMP43121 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MCAMP43121 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MCAMP43121 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MCAMP43121 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MCAMP43121 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MCAMP43121 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MCAMP43121 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MCAMP43121 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MCAMP43121 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MCAMP43121 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MCAMP43121 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MCAMP43121 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MCAMP43121 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MCAMP43121 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MCAMP43121 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MCAMP43121 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MCAMP43121 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MCAMP43121 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MCAMP43121 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MCAMP43121 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MCAMP43121 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MCAMP43121 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MCAMP43121 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MCAMP43121 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MCAMP43121 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
MCAMP43121 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MCAMP43121 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MCAMP43121 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MCAMP43121 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MCAMP43121 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MCAMP43121 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MCAMP43121 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MCAMP43121 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
MCAMP43121 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
MCAMP43121 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MCAMP43121 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MCAMP43121 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MCAMP43121 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MCAMP43121 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MCAMP43121 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
MCAMP43121 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MCAMP43121 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MCAMP43121 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MCAMP43121 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MCAMP43121 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MCAMP43121 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MCAMP43121 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
MCAMP43121 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MCAMP43121 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MCAMP43121 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MCAMP43121 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MCAMP43121 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MCAMP43121 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MCAMP43121 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MCAMP43121 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MCAMP43121 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MCAMP43121 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MCAMP43121 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MCAMP43121 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MCAMP43121 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MCAMP43121 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MCAMP43121 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MCAMP43121 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MCAMP43121 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MCAMP43121 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MCAMP43121 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MCAMP43121 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MCAMP43121 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MCAMP43121 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
MCAMP43121 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MCAMP43121 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
MCAMP43121 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MCAMP43121 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MCAMP43121 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MCAMP43121 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MCAMP43121 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MCAMP43121 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MCAMP43121 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MCAMP43121 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MCAMP43121 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MCAMP43121 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MCAMP43121 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MCAMP43121 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MCAMP43121 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MCAMP43121 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MCAMP43121 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MCAMP43121 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
MCAMP43121 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MCAMP43121 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MCAMP43121 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MCAMP43121 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MCAMP43121 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms