Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP5C1P36542 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP5C1P36542 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP5C1P36542 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP5C1P36542 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP5C1P36542 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP5C1P36542 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP5C1P36542 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP5C1P36542 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP5C1P36542 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP5C1P36542 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP5C1P36542 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP5C1P36542 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP5C1P36542 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP5C1P36542 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP5C1P36542 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP5C1P36542 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP5C1P36542 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP5C1P36542 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP5C1P36542 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP5C1P36542 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP5C1P36542 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP5C1P36542 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP5C1P36542 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP5C1P36542 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP5C1P36542 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP5C1P36542 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP5C1P36542 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP5C1P36542 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP5C1P36542 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP5C1P36542 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP5C1P36542 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP5C1P36542 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP5C1P36542 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP5C1P36542 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP5C1P36542 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP5C1P36542 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP5C1P36542 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP5C1P36542 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP5C1P36542 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP5C1P36542 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP5C1P36542 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP5C1P36542 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP5C1P36542 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP5C1P36542 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP5C1P36542 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP5C1P36542 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP5C1P36542 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP5C1P36542 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP5C1P36542 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP5C1P36542 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP5C1P36542 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP5C1P36542 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP5C1P36542 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP5C1P36542 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP5C1P36542 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP5C1P36542 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP5C1P36542 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP5C1P36542 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP5C1P36542 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP5C1P36542 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP5C1P36542 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP5C1P36542 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP5C1P36542 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP5C1P36542 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP5C1P36542 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP5C1P36542 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP5C1P36542 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP5C1P36542 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP5C1P36542 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP5C1P36542 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP5C1P36542 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP5C1P36542 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP5C1P36542 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP5C1P36542 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP5C1P36542 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP5C1P36542 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP5C1P36542 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP5C1P36542 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP5C1P36542 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP5C1P36542 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP5C1P36542 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP5C1P36542 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP5C1P36542 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP5C1P36542 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP5C1P36542 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP5C1P36542 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP5C1P36542 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP5C1P36542 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP5C1P36542 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP5C1P36542 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP5C1P36542 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP5C1P36542 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATP5C1P36542 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATP5C1P36542 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATP5C1P36542 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATP5C1P36542 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATP5C1P36542 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATP5C1P36542 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATP5C1P36542 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms