Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXD12P35452 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXD12P35452 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXD12P35452 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXD12P35452 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXD12P35452 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXD12P35452 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXD12P35452 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXD12P35452 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXD12P35452 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXD12P35452 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXD12P35452 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXD12P35452 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXD12P35452 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXD12P35452 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXD12P35452 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXD12P35452 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXD12P35452 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXD12P35452 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXD12P35452 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXD12P35452 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXD12P35452 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXD12P35452 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXD12P35452 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXD12P35452 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXD12P35452 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXD12P35452 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXD12P35452 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXD12P35452 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXD12P35452 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXD12P35452 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXD12P35452 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXD12P35452 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXD12P35452 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXD12P35452 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HOXD12P35452 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HOXD12P35452 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXD12P35452 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXD12P35452 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXD12P35452 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXD12P35452 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXD12P35452 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXD12P35452 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXD12P35452 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXD12P35452 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXD12P35452 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXD12P35452 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXD12P35452 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXD12P35452 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXD12P35452 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXD12P35452 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXD12P35452 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXD12P35452 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXD12P35452 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXD12P35452 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXD12P35452 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXD12P35452 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXD12P35452 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXD12P35452 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXD12P35452 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXD12P35452 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXD12P35452 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXD12P35452 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXD12P35452 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXD12P35452 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXD12P35452 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXD12P35452 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXD12P35452 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXD12P35452 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXD12P35452 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXD12P35452 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXD12P35452 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXD12P35452 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXD12P35452 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXD12P35452 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXD12P35452 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXD12P35452 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXD12P35452 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXD12P35452 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXD12P35452 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXD12P35452 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXD12P35452 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXD12P35452 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXD12P35452 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXD12P35452 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXD12P35452 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXD12P35452 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXD12P35452 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXD12P35452 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXD12P35452 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXD12P35452 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXD12P35452 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXD12P35452 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXD12P35452 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXD12P35452 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXD12P35452 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXD12P35452 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXD12P35452 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXD12P35452 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXD12P35452 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms