Protein–RNA interactions for Protein: P32926

DSG3, Desmoglein-3, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG3P32926 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DSG3P32926 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DSG3P32926 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DSG3P32926 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DSG3P32926 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DSG3P32926 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DSG3P32926 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DSG3P32926 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DSG3P32926 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DSG3P32926 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DSG3P32926 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DSG3P32926 MTND2P25-201ENST00000449028 610 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
DSG3P32926 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DSG3P32926 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DSG3P32926 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DSG3P32926 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DSG3P32926 AC008277.1-203ENST00000594921 1149 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DSG3P32926 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
DSG3P32926 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DSG3P32926 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DSG3P32926 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DSG3P32926 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DSG3P32926 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DSG3P32926 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DSG3P32926 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DSG3P32926 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DSG3P32926 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DSG3P32926 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DSG3P32926 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DSG3P32926 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DSG3P32926 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DSG3P32926 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DSG3P32926 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
DSG3P32926 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DSG3P32926 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DSG3P32926 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DSG3P32926 AC027281.2-201ENST00000623856 713 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
DSG3P32926 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DSG3P32926 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DSG3P32926 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DSG3P32926 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DSG3P32926 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DSG3P32926 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DSG3P32926 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
DSG3P32926 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DSG3P32926 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
DSG3P32926 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DSG3P32926 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
DSG3P32926 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DSG3P32926 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DSG3P32926 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DSG3P32926 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DSG3P32926 AL158013.1-202ENST00000419666 520 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DSG3P32926 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DSG3P32926 AL117351.1-201ENST00000438864 766 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
DSG3P32926 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DSG3P32926 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DSG3P32926 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
DSG3P32926 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
DSG3P32926 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DSG3P32926 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DSG3P32926 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DSG3P32926 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
DSG3P32926 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DSG3P32926 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DSG3P32926 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DSG3P32926 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DSG3P32926 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DSG3P32926 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DSG3P32926 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DSG3P32926 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DSG3P32926 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
DSG3P32926 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DSG3P32926 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DSG3P32926 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DSG3P32926 AL606534.3-201ENST00000437499 373 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DSG3P32926 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DSG3P32926 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DSG3P32926 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DSG3P32926 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
DSG3P32926 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DSG3P32926 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DSG3P32926 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DSG3P32926 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DSG3P32926 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DSG3P32926 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DSG3P32926 AC107068.2-201ENST00000634611 447 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DSG3P32926 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DSG3P32926 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
DSG3P32926 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DSG3P32926 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DSG3P32926 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DSG3P32926 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DSG3P32926 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DSG3P32926 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DSG3P32926 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DSG3P32926 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
DSG3P32926 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DSG3P32926 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DSG3P32926 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms