Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNGA1P29973 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CNGA1P29973 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNGA1P29973 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNGA1P29973 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNGA1P29973 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNGA1P29973 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNGA1P29973 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNGA1P29973 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNGA1P29973 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNGA1P29973 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNGA1P29973 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNGA1P29973 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNGA1P29973 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CNGA1P29973 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNGA1P29973 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNGA1P29973 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNGA1P29973 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNGA1P29973 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CNGA1P29973 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNGA1P29973 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNGA1P29973 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNGA1P29973 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNGA1P29973 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNGA1P29973 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNGA1P29973 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNGA1P29973 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNGA1P29973 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNGA1P29973 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNGA1P29973 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNGA1P29973 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNGA1P29973 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNGA1P29973 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CNGA1P29973 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNGA1P29973 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNGA1P29973 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CNGA1P29973 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNGA1P29973 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNGA1P29973 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNGA1P29973 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNGA1P29973 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNGA1P29973 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CNGA1P29973 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CNGA1P29973 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNGA1P29973 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNGA1P29973 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CNGA1P29973 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CNGA1P29973 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CNGA1P29973 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CNGA1P29973 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CNGA1P29973 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNGA1P29973 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNGA1P29973 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNGA1P29973 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNGA1P29973 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNGA1P29973 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNGA1P29973 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNGA1P29973 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CNGA1P29973 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNGA1P29973 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNGA1P29973 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNGA1P29973 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNGA1P29973 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNGA1P29973 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNGA1P29973 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNGA1P29973 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNGA1P29973 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNGA1P29973 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNGA1P29973 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNGA1P29973 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CNGA1P29973 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNGA1P29973 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CNGA1P29973 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNGA1P29973 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CNGA1P29973 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNGA1P29973 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNGA1P29973 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNGA1P29973 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNGA1P29973 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNGA1P29973 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNGA1P29973 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNGA1P29973 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNGA1P29973 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNGA1P29973 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNGA1P29973 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNGA1P29973 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNGA1P29973 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CNGA1P29973 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNGA1P29973 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CNGA1P29973 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNGA1P29973 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNGA1P29973 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CNGA1P29973 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CNGA1P29973 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNGA1P29973 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNGA1P29973 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNGA1P29973 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNGA1P29973 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNGA1P29973 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNGA1P29973 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms