Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD40LGP29965 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD40LGP29965 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD40LGP29965 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD40LGP29965 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD40LGP29965 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD40LGP29965 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD40LGP29965 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD40LGP29965 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD40LGP29965 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD40LGP29965 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD40LGP29965 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD40LGP29965 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD40LGP29965 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CD40LGP29965 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD40LGP29965 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD40LGP29965 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD40LGP29965 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD40LGP29965 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD40LGP29965 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD40LGP29965 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD40LGP29965 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD40LGP29965 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CD40LGP29965 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD40LGP29965 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD40LGP29965 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD40LGP29965 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD40LGP29965 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD40LGP29965 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD40LGP29965 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD40LGP29965 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD40LGP29965 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD40LGP29965 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD40LGP29965 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD40LGP29965 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD40LGP29965 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD40LGP29965 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD40LGP29965 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD40LGP29965 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD40LGP29965 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD40LGP29965 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD40LGP29965 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD40LGP29965 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD40LGP29965 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD40LGP29965 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD40LGP29965 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD40LGP29965 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD40LGP29965 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD40LGP29965 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD40LGP29965 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CD40LGP29965 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD40LGP29965 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD40LGP29965 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD40LGP29965 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD40LGP29965 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD40LGP29965 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD40LGP29965 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CD40LGP29965 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD40LGP29965 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD40LGP29965 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD40LGP29965 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD40LGP29965 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD40LGP29965 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD40LGP29965 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD40LGP29965 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD40LGP29965 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD40LGP29965 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD40LGP29965 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD40LGP29965 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD40LGP29965 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD40LGP29965 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD40LGP29965 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD40LGP29965 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD40LGP29965 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD40LGP29965 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD40LGP29965 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CD40LGP29965 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD40LGP29965 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD40LGP29965 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD40LGP29965 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD40LGP29965 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD40LGP29965 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD40LGP29965 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD40LGP29965 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CD40LGP29965 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CD40LGP29965 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD40LGP29965 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD40LGP29965 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD40LGP29965 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD40LGP29965 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD40LGP29965 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD40LGP29965 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CD40LGP29965 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CD40LGP29965 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CD40LGP29965 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CD40LGP29965 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CD40LGP29965 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CD40LGP29965 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CD40LGP29965 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CD40LGP29965 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms