Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CASP1P29466 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CASP1P29466 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CASP1P29466 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CASP1P29466 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CASP1P29466 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CASP1P29466 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CASP1P29466 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CASP1P29466 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CASP1P29466 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CASP1P29466 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CASP1P29466 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CASP1P29466 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CASP1P29466 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CASP1P29466 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CASP1P29466 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CASP1P29466 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CASP1P29466 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CASP1P29466 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CASP1P29466 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CASP1P29466 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CASP1P29466 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CASP1P29466 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CASP1P29466 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CASP1P29466 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CASP1P29466 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CASP1P29466 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CASP1P29466 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CASP1P29466 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CASP1P29466 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CASP1P29466 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CASP1P29466 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CASP1P29466 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CASP1P29466 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CASP1P29466 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CASP1P29466 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CASP1P29466 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CASP1P29466 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CASP1P29466 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CASP1P29466 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CASP1P29466 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CASP1P29466 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CASP1P29466 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CASP1P29466 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CASP1P29466 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CASP1P29466 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CASP1P29466 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CASP1P29466 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CASP1P29466 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CASP1P29466 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CASP1P29466 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CASP1P29466 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CASP1P29466 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CASP1P29466 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CASP1P29466 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CASP1P29466 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CASP1P29466 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CASP1P29466 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CASP1P29466 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CASP1P29466 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CASP1P29466 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CASP1P29466 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CASP1P29466 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CASP1P29466 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CASP1P29466 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CASP1P29466 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CASP1P29466 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CASP1P29466 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CASP1P29466 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CASP1P29466 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CASP1P29466 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CASP1P29466 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CASP1P29466 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CASP1P29466 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CASP1P29466 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
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CASP1P29466 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CASP1P29466 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CASP1P29466 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CASP1P29466 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CASP1P29466 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CASP1P29466 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CASP1P29466 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CASP1P29466 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CASP1P29466 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CASP1P29466 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CASP1P29466 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CASP1P29466 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CASP1P29466 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CASP1P29466 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CASP1P29466 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CASP1P29466 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CASP1P29466 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CASP1P29466 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CASP1P29466 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CASP1P29466 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CASP1P29466 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CASP1P29466 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CASP1P29466 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CASP1P29466 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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