Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GJB2P29033 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GJB2P29033 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GJB2P29033 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GJB2P29033 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJB2P29033 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJB2P29033 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJB2P29033 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJB2P29033 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJB2P29033 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJB2P29033 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJB2P29033 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJB2P29033 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJB2P29033 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJB2P29033 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJB2P29033 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJB2P29033 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJB2P29033 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GJB2P29033 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GJB2P29033 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GJB2P29033 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GJB2P29033 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GJB2P29033 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GJB2P29033 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GJB2P29033 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GJB2P29033 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GJB2P29033 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GJB2P29033 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GJB2P29033 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GJB2P29033 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GJB2P29033 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
GJB2P29033 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GJB2P29033 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GJB2P29033 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GJB2P29033 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJB2P29033 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJB2P29033 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJB2P29033 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJB2P29033 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJB2P29033 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJB2P29033 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJB2P29033 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJB2P29033 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJB2P29033 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJB2P29033 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GJB2P29033 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJB2P29033 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJB2P29033 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJB2P29033 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJB2P29033 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJB2P29033 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJB2P29033 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJB2P29033 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJB2P29033 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJB2P29033 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJB2P29033 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJB2P29033 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJB2P29033 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJB2P29033 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJB2P29033 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJB2P29033 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJB2P29033 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJB2P29033 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJB2P29033 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJB2P29033 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJB2P29033 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJB2P29033 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJB2P29033 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJB2P29033 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJB2P29033 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJB2P29033 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJB2P29033 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJB2P29033 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJB2P29033 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
GJB2P29033 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJB2P29033 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJB2P29033 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJB2P29033 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJB2P29033 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJB2P29033 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJB2P29033 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJB2P29033 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJB2P29033 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJB2P29033 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJB2P29033 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJB2P29033 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GJB2P29033 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GJB2P29033 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GJB2P29033 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GJB2P29033 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GJB2P29033 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
GJB2P29033 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GJB2P29033 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GJB2P29033 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GJB2P29033 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GJB2P29033 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GJB2P29033 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GJB2P29033 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GJB2P29033 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GJB2P29033 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms