Protein–RNA interactions for Protein: P28329

CHAT, Choline O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHATP28329 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHATP28329 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHATP28329 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHATP28329 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHATP28329 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHATP28329 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHATP28329 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHATP28329 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHATP28329 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHATP28329 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHATP28329 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHATP28329 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CHATP28329 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CHATP28329 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHATP28329 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHATP28329 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHATP28329 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHATP28329 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHATP28329 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHATP28329 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHATP28329 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHATP28329 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHATP28329 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHATP28329 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHATP28329 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHATP28329 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHATP28329 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHATP28329 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHATP28329 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHATP28329 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CHATP28329 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CHATP28329 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHATP28329 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHATP28329 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CHATP28329 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHATP28329 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHATP28329 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHATP28329 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHATP28329 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHATP28329 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHATP28329 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHATP28329 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHATP28329 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHATP28329 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHATP28329 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHATP28329 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHATP28329 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHATP28329 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHATP28329 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHATP28329 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHATP28329 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHATP28329 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHATP28329 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHATP28329 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHATP28329 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHATP28329 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHATP28329 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHATP28329 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHATP28329 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHATP28329 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHATP28329 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHATP28329 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHATP28329 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHATP28329 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHATP28329 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHATP28329 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHATP28329 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHATP28329 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHATP28329 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHATP28329 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHATP28329 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHATP28329 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHATP28329 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHATP28329 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHATP28329 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHATP28329 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHATP28329 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHATP28329 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHATP28329 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHATP28329 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHATP28329 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHATP28329 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHATP28329 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHATP28329 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHATP28329 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHATP28329 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHATP28329 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHATP28329 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHATP28329 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHATP28329 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHATP28329 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHATP28329 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHATP28329 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHATP28329 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHATP28329 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHATP28329 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHATP28329 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHATP28329 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHATP28329 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHATP28329 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms