Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPRBP23467 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPRBP23467 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRBP23467 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRBP23467 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRBP23467 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRBP23467 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRBP23467 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRBP23467 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRBP23467 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRBP23467 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRBP23467 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRBP23467 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRBP23467 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRBP23467 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRBP23467 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRBP23467 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRBP23467 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRBP23467 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRBP23467 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRBP23467 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRBP23467 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRBP23467 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRBP23467 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRBP23467 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRBP23467 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRBP23467 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRBP23467 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRBP23467 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRBP23467 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRBP23467 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRBP23467 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRBP23467 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRBP23467 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRBP23467 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRBP23467 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRBP23467 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRBP23467 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRBP23467 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRBP23467 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRBP23467 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRBP23467 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRBP23467 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRBP23467 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRBP23467 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRBP23467 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRBP23467 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRBP23467 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRBP23467 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRBP23467 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRBP23467 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRBP23467 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRBP23467 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRBP23467 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRBP23467 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRBP23467 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRBP23467 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRBP23467 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRBP23467 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRBP23467 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRBP23467 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRBP23467 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRBP23467 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRBP23467 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRBP23467 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRBP23467 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRBP23467 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRBP23467 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRBP23467 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRBP23467 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRBP23467 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRBP23467 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRBP23467 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRBP23467 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRBP23467 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRBP23467 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRBP23467 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRBP23467 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRBP23467 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRBP23467 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRBP23467 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRBP23467 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRBP23467 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRBP23467 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRBP23467 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRBP23467 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRBP23467 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRBP23467 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRBP23467 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRBP23467 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRBP23467 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRBP23467 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRBP23467 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRBP23467 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRBP23467 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRBP23467 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRBP23467 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRBP23467 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRBP23467 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRBP23467 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
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