Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYT1P21579 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYT1P21579 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYT1P21579 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYT1P21579 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYT1P21579 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYT1P21579 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYT1P21579 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYT1P21579 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYT1P21579 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYT1P21579 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYT1P21579 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYT1P21579 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYT1P21579 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYT1P21579 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYT1P21579 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYT1P21579 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYT1P21579 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYT1P21579 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYT1P21579 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYT1P21579 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYT1P21579 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYT1P21579 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYT1P21579 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYT1P21579 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYT1P21579 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYT1P21579 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYT1P21579 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYT1P21579 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYT1P21579 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYT1P21579 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYT1P21579 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYT1P21579 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYT1P21579 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYT1P21579 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYT1P21579 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYT1P21579 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYT1P21579 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SYT1P21579 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SYT1P21579 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYT1P21579 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYT1P21579 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYT1P21579 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYT1P21579 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYT1P21579 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYT1P21579 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYT1P21579 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYT1P21579 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYT1P21579 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYT1P21579 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYT1P21579 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYT1P21579 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYT1P21579 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYT1P21579 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYT1P21579 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYT1P21579 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYT1P21579 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYT1P21579 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYT1P21579 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYT1P21579 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYT1P21579 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYT1P21579 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYT1P21579 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SYT1P21579 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYT1P21579 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYT1P21579 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYT1P21579 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYT1P21579 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYT1P21579 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYT1P21579 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYT1P21579 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYT1P21579 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYT1P21579 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYT1P21579 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYT1P21579 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYT1P21579 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYT1P21579 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYT1P21579 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYT1P21579 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYT1P21579 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYT1P21579 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYT1P21579 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYT1P21579 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYT1P21579 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYT1P21579 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYT1P21579 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYT1P21579 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SYT1P21579 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYT1P21579 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYT1P21579 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYT1P21579 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYT1P21579 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYT1P21579 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYT1P21579 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYT1P21579 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYT1P21579 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYT1P21579 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYT1P21579 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYT1P21579 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYT1P21579 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms