Protein–RNA interactions for Protein: P20339

RAB5A, Ras-related protein Rab-5A, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5AP20339 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RAB5AP20339 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RAB5AP20339 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RAB5AP20339 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
RAB5AP20339 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RAB5AP20339 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
RAB5AP20339 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RAB5AP20339 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RAB5AP20339 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RAB5AP20339 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RAB5AP20339 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RAB5AP20339 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB5AP20339 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB5AP20339 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB5AP20339 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB5AP20339 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB5AP20339 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB5AP20339 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB5AP20339 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB5AP20339 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB5AP20339 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB5AP20339 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB5AP20339 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB5AP20339 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB5AP20339 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB5AP20339 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB5AP20339 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB5AP20339 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB5AP20339 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB5AP20339 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB5AP20339 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB5AP20339 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB5AP20339 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB5AP20339 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB5AP20339 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB5AP20339 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB5AP20339 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB5AP20339 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB5AP20339 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB5AP20339 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB5AP20339 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB5AP20339 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB5AP20339 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB5AP20339 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB5AP20339 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB5AP20339 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB5AP20339 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB5AP20339 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB5AP20339 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB5AP20339 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms