Protein–RNA interactions for Protein: P20020

ATP2B1, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B1P20020 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP2B1P20020 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP2B1P20020 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP2B1P20020 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP2B1P20020 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP2B1P20020 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP2B1P20020 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP2B1P20020 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP2B1P20020 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP2B1P20020 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP2B1P20020 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP2B1P20020 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP2B1P20020 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP2B1P20020 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP2B1P20020 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP2B1P20020 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP2B1P20020 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP2B1P20020 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP2B1P20020 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP2B1P20020 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP2B1P20020 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP2B1P20020 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP2B1P20020 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP2B1P20020 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP2B1P20020 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP2B1P20020 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP2B1P20020 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP2B1P20020 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP2B1P20020 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP2B1P20020 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP2B1P20020 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP2B1P20020 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP2B1P20020 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP2B1P20020 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP2B1P20020 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP2B1P20020 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP2B1P20020 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP2B1P20020 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP2B1P20020 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP2B1P20020 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP2B1P20020 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP2B1P20020 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP2B1P20020 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP2B1P20020 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP2B1P20020 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP2B1P20020 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP2B1P20020 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP2B1P20020 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP2B1P20020 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP2B1P20020 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP2B1P20020 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP2B1P20020 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP2B1P20020 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP2B1P20020 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP2B1P20020 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP2B1P20020 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP2B1P20020 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP2B1P20020 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP2B1P20020 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP2B1P20020 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP2B1P20020 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP2B1P20020 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP2B1P20020 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP2B1P20020 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP2B1P20020 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP2B1P20020 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP2B1P20020 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP2B1P20020 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP2B1P20020 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP2B1P20020 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP2B1P20020 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP2B1P20020 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP2B1P20020 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP2B1P20020 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP2B1P20020 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP2B1P20020 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP2B1P20020 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP2B1P20020 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP2B1P20020 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP2B1P20020 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP2B1P20020 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP2B1P20020 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP2B1P20020 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP2B1P20020 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP2B1P20020 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP2B1P20020 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP2B1P20020 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP2B1P20020 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP2B1P20020 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP2B1P20020 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP2B1P20020 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP2B1P20020 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP2B1P20020 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP2B1P20020 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP2B1P20020 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP2B1P20020 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP2B1P20020 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP2B1P20020 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP2B1P20020 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP2B1P20020 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms