Protein–RNA interactions for Protein: P19634

SLC9A1, Sodium/hydrogen exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A1P19634 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC9A1P19634 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC9A1P19634 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC9A1P19634 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC9A1P19634 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC9A1P19634 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC9A1P19634 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC9A1P19634 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC9A1P19634 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC9A1P19634 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC9A1P19634 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC9A1P19634 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC9A1P19634 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC9A1P19634 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC9A1P19634 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC9A1P19634 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC9A1P19634 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC9A1P19634 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC9A1P19634 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC9A1P19634 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC9A1P19634 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC9A1P19634 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC9A1P19634 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC9A1P19634 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC9A1P19634 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC9A1P19634 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC9A1P19634 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC9A1P19634 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC9A1P19634 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC9A1P19634 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC9A1P19634 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC9A1P19634 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC9A1P19634 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC9A1P19634 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC9A1P19634 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC9A1P19634 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC9A1P19634 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC9A1P19634 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC9A1P19634 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC9A1P19634 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC9A1P19634 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
SLC9A1P19634 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC9A1P19634 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC9A1P19634 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC9A1P19634 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC9A1P19634 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC9A1P19634 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC9A1P19634 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC9A1P19634 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC9A1P19634 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC9A1P19634 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC9A1P19634 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC9A1P19634 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC9A1P19634 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC9A1P19634 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC9A1P19634 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC9A1P19634 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC9A1P19634 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC9A1P19634 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC9A1P19634 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC9A1P19634 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC9A1P19634 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC9A1P19634 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC9A1P19634 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC9A1P19634 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC9A1P19634 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC9A1P19634 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC9A1P19634 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC9A1P19634 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC9A1P19634 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC9A1P19634 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC9A1P19634 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC9A1P19634 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC9A1P19634 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC9A1P19634 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC9A1P19634 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC9A1P19634 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC9A1P19634 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC9A1P19634 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC9A1P19634 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC9A1P19634 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC9A1P19634 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC9A1P19634 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC9A1P19634 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC9A1P19634 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC9A1P19634 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC9A1P19634 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC9A1P19634 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC9A1P19634 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC9A1P19634 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC9A1P19634 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC9A1P19634 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC9A1P19634 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC9A1P19634 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC9A1P19634 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC9A1P19634 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC9A1P19634 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC9A1P19634 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC9A1P19634 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC9A1P19634 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms