Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATF3P18847 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATF3P18847 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATF3P18847 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATF3P18847 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATF3P18847 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATF3P18847 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
ATF3P18847 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATF3P18847 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATF3P18847 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATF3P18847 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATF3P18847 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATF3P18847 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATF3P18847 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
ATF3P18847 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATF3P18847 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATF3P18847 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATF3P18847 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATF3P18847 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATF3P18847 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATF3P18847 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATF3P18847 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATF3P18847 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATF3P18847 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATF3P18847 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
ATF3P18847 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATF3P18847 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATF3P18847 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATF3P18847 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATF3P18847 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATF3P18847 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATF3P18847 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
ATF3P18847 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATF3P18847 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATF3P18847 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATF3P18847 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATF3P18847 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATF3P18847 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATF3P18847 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATF3P18847 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
ATF3P18847 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
ATF3P18847 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATF3P18847 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATF3P18847 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATF3P18847 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATF3P18847 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATF3P18847 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
ATF3P18847 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATF3P18847 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATF3P18847 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATF3P18847 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
ATF3P18847 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATF3P18847 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
ATF3P18847 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC27.08■■□□□ 1.92
ATF3P18847 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATF3P18847 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATF3P18847 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATF3P18847 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATF3P18847 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATF3P18847 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATF3P18847 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATF3P18847 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATF3P18847 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
ATF3P18847 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATF3P18847 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATF3P18847 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
ATF3P18847 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATF3P18847 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATF3P18847 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
ATF3P18847 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATF3P18847 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATF3P18847 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATF3P18847 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATF3P18847 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATF3P18847 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATF3P18847 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATF3P18847 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATF3P18847 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATF3P18847 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATF3P18847 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATF3P18847 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
ATF3P18847 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATF3P18847 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATF3P18847 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATF3P18847 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATF3P18847 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATF3P18847 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATF3P18847 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATF3P18847 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATF3P18847 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATF3P18847 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATF3P18847 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
ATF3P18847 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATF3P18847 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATF3P18847 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
ATF3P18847 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATF3P18847 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATF3P18847 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATF3P18847 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
ATF3P18847 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms