Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRAP18433 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRAP18433 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRAP18433 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRAP18433 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRAP18433 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRAP18433 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRAP18433 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRAP18433 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRAP18433 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRAP18433 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRAP18433 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRAP18433 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRAP18433 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRAP18433 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRAP18433 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRAP18433 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRAP18433 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRAP18433 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRAP18433 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRAP18433 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRAP18433 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRAP18433 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRAP18433 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRAP18433 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRAP18433 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRAP18433 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRAP18433 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRAP18433 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRAP18433 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRAP18433 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRAP18433 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRAP18433 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRAP18433 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRAP18433 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRAP18433 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRAP18433 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRAP18433 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRAP18433 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRAP18433 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRAP18433 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRAP18433 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRAP18433 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRAP18433 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRAP18433 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRAP18433 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRAP18433 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRAP18433 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRAP18433 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRAP18433 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRAP18433 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRAP18433 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRAP18433 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRAP18433 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRAP18433 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRAP18433 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRAP18433 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRAP18433 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRAP18433 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRAP18433 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRAP18433 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRAP18433 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRAP18433 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRAP18433 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRAP18433 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRAP18433 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRAP18433 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRAP18433 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRAP18433 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRAP18433 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRAP18433 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRAP18433 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRAP18433 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRAP18433 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRAP18433 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRAP18433 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRAP18433 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRAP18433 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRAP18433 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRAP18433 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRAP18433 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRAP18433 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRAP18433 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRAP18433 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRAP18433 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRAP18433 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRAP18433 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRAP18433 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRAP18433 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRAP18433 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRAP18433 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRAP18433 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRAP18433 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRAP18433 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRAP18433 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRAP18433 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRAP18433 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRAP18433 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PTPRAP18433 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRAP18433 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms