Protein–RNA interactions for Protein: P16070

CD44, CD44 antigen, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD44P16070 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CD44P16070 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CD44P16070 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CD44P16070 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CD44P16070 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CD44P16070 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CD44P16070 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CD44P16070 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CD44P16070 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CD44P16070 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CD44P16070 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CD44P16070 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CD44P16070 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CD44P16070 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CD44P16070 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CD44P16070 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CD44P16070 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CD44P16070 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CD44P16070 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CD44P16070 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CD44P16070 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CD44P16070 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CD44P16070 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CD44P16070 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CD44P16070 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CD44P16070 ATP5L2-201ENST00000505920 799 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CD44P16070 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CD44P16070 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CD44P16070 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CD44P16070 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CD44P16070 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CD44P16070 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CD44P16070 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CD44P16070 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CD44P16070 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CD44P16070 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CD44P16070 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CD44P16070 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CD44P16070 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CD44P16070 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CD44P16070 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CD44P16070 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CD44P16070 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CD44P16070 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CD44P16070 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CD44P16070 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CD44P16070 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CD44P16070 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CD44P16070 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CD44P16070 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CD44P16070 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CD44P16070 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CD44P16070 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CD44P16070 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CD44P16070 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CD44P16070 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CD44P16070 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CD44P16070 ATP6V1G1-201ENST00000374050 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CD44P16070 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CD44P16070 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CD44P16070 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CD44P16070 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CD44P16070 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CD44P16070 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CD44P16070 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CD44P16070 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CD44P16070 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CD44P16070 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CD44P16070 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CD44P16070 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CD44P16070 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CD44P16070 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CD44P16070 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CD44P16070 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CD44P16070 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CD44P16070 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CD44P16070 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CD44P16070 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CD44P16070 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CD44P16070 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CD44P16070 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CD44P16070 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CD44P16070 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CD44P16070 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CD44P16070 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CD44P16070 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CD44P16070 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CD44P16070 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CD44P16070 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CD44P16070 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CD44P16070 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CD44P16070 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CD44P16070 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CD44P16070 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CD44P16070 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CD44P16070 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CD44P16070 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CD44P16070 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CD44P16070 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CD44P16070 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms