Protein–RNA interactions for Protein: P12838

DEFA4, Neutrophil defensin 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA4P12838 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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DEFA4P12838 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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DEFA4P12838 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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DEFA4P12838 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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