Protein–RNA interactions for Protein: P12074

COX6A1, Cytochrome c oxidase subunit 6A1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX6A1P12074 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
COX6A1P12074 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
COX6A1P12074 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
COX6A1P12074 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
COX6A1P12074 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
COX6A1P12074 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
COX6A1P12074 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
COX6A1P12074 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
COX6A1P12074 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
COX6A1P12074 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
COX6A1P12074 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
COX6A1P12074 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
COX6A1P12074 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
COX6A1P12074 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
COX6A1P12074 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
COX6A1P12074 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
COX6A1P12074 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
COX6A1P12074 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
COX6A1P12074 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
COX6A1P12074 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
COX6A1P12074 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COX6A1P12074 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
COX6A1P12074 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
COX6A1P12074 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
COX6A1P12074 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COX6A1P12074 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
COX6A1P12074 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COX6A1P12074 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COX6A1P12074 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COX6A1P12074 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
COX6A1P12074 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
COX6A1P12074 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
COX6A1P12074 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COX6A1P12074 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COX6A1P12074 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COX6A1P12074 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COX6A1P12074 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
COX6A1P12074 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
COX6A1P12074 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
COX6A1P12074 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
COX6A1P12074 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
COX6A1P12074 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
COX6A1P12074 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
COX6A1P12074 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
COX6A1P12074 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
COX6A1P12074 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
COX6A1P12074 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
COX6A1P12074 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
COX6A1P12074 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
COX6A1P12074 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
COX6A1P12074 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
COX6A1P12074 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
COX6A1P12074 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
COX6A1P12074 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
COX6A1P12074 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
COX6A1P12074 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
COX6A1P12074 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
COX6A1P12074 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
COX6A1P12074 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
COX6A1P12074 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
COX6A1P12074 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
COX6A1P12074 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
COX6A1P12074 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
COX6A1P12074 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
COX6A1P12074 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
COX6A1P12074 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
COX6A1P12074 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
COX6A1P12074 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
COX6A1P12074 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
COX6A1P12074 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
COX6A1P12074 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
COX6A1P12074 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
COX6A1P12074 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
COX6A1P12074 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
COX6A1P12074 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
COX6A1P12074 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
COX6A1P12074 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
COX6A1P12074 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
COX6A1P12074 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
COX6A1P12074 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
COX6A1P12074 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
COX6A1P12074 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
COX6A1P12074 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
COX6A1P12074 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
COX6A1P12074 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
COX6A1P12074 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
COX6A1P12074 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
COX6A1P12074 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COX6A1P12074 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COX6A1P12074 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COX6A1P12074 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COX6A1P12074 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COX6A1P12074 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
COX6A1P12074 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COX6A1P12074 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COX6A1P12074 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COX6A1P12074 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
COX6A1P12074 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
COX6A1P12074 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
COX6A1P12074 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms