Protein–RNA interactions for Protein: P0DI82

TRAPPC2B, Trafficking protein particle complex subunit 2B, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2BP0DI82 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAPPC2BP0DI82 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAPPC2BP0DI82 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAPPC2BP0DI82 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAPPC2BP0DI82 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAPPC2BP0DI82 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAPPC2BP0DI82 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAPPC2BP0DI82 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAPPC2BP0DI82 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAPPC2BP0DI82 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAPPC2BP0DI82 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAPPC2BP0DI82 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAPPC2BP0DI82 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAPPC2BP0DI82 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAPPC2BP0DI82 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAPPC2BP0DI82 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAPPC2BP0DI82 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAPPC2BP0DI82 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAPPC2BP0DI82 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAPPC2BP0DI82 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAPPC2BP0DI82 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAPPC2BP0DI82 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAPPC2BP0DI82 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAPPC2BP0DI82 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAPPC2BP0DI82 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAPPC2BP0DI82 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAPPC2BP0DI82 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAPPC2BP0DI82 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAPPC2BP0DI82 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAPPC2BP0DI82 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAPPC2BP0DI82 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAPPC2BP0DI82 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAPPC2BP0DI82 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAPPC2BP0DI82 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAPPC2BP0DI82 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAPPC2BP0DI82 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAPPC2BP0DI82 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAPPC2BP0DI82 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAPPC2BP0DI82 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAPPC2BP0DI82 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAPPC2BP0DI82 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAPPC2BP0DI82 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAPPC2BP0DI82 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAPPC2BP0DI82 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAPPC2BP0DI82 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAPPC2BP0DI82 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAPPC2BP0DI82 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAPPC2BP0DI82 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAPPC2BP0DI82 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAPPC2BP0DI82 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAPPC2BP0DI82 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAPPC2BP0DI82 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAPPC2BP0DI82 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAPPC2BP0DI82 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAPPC2BP0DI82 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAPPC2BP0DI82 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAPPC2BP0DI82 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAPPC2BP0DI82 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAPPC2BP0DI82 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAPPC2BP0DI82 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAPPC2BP0DI82 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAPPC2BP0DI82 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAPPC2BP0DI82 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAPPC2BP0DI82 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAPPC2BP0DI82 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAPPC2BP0DI82 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAPPC2BP0DI82 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAPPC2BP0DI82 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAPPC2BP0DI82 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAPPC2BP0DI82 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAPPC2BP0DI82 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAPPC2BP0DI82 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAPPC2BP0DI82 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAPPC2BP0DI82 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAPPC2BP0DI82 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAPPC2BP0DI82 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAPPC2BP0DI82 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAPPC2BP0DI82 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAPPC2BP0DI82 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAPPC2BP0DI82 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAPPC2BP0DI82 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAPPC2BP0DI82 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAPPC2BP0DI82 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAPPC2BP0DI82 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAPPC2BP0DI82 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAPPC2BP0DI82 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAPPC2BP0DI82 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAPPC2BP0DI82 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAPPC2BP0DI82 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAPPC2BP0DI82 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAPPC2BP0DI82 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAPPC2BP0DI82 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAPPC2BP0DI82 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAPPC2BP0DI82 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAPPC2BP0DI82 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAPPC2BP0DI82 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAPPC2BP0DI82 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAPPC2BP0DI82 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAPPC2BP0DI82 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAPPC2BP0DI82 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms