Protein–RNA interactions for Protein: P08118

MSMB, Beta-microseminoprotein, humanhuman

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMBP08118 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MSMBP08118 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MSMBP08118 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MSMBP08118 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MSMBP08118 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MSMBP08118 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MSMBP08118 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MSMBP08118 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MSMBP08118 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MSMBP08118 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MSMBP08118 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MSMBP08118 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MSMBP08118 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MSMBP08118 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MSMBP08118 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MSMBP08118 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MSMBP08118 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MSMBP08118 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MSMBP08118 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MSMBP08118 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MSMBP08118 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MSMBP08118 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MSMBP08118 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MSMBP08118 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MSMBP08118 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MSMBP08118 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MSMBP08118 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MSMBP08118 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MSMBP08118 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MSMBP08118 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MSMBP08118 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MSMBP08118 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MSMBP08118 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MSMBP08118 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MSMBP08118 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MSMBP08118 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MSMBP08118 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MSMBP08118 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MSMBP08118 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MSMBP08118 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MSMBP08118 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MSMBP08118 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MSMBP08118 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MSMBP08118 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MSMBP08118 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MSMBP08118 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MSMBP08118 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MSMBP08118 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MSMBP08118 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MSMBP08118 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MSMBP08118 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MSMBP08118 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MSMBP08118 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MSMBP08118 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MSMBP08118 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MSMBP08118 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MSMBP08118 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MSMBP08118 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MSMBP08118 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MSMBP08118 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MSMBP08118 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MSMBP08118 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MSMBP08118 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MSMBP08118 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MSMBP08118 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MSMBP08118 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MSMBP08118 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MSMBP08118 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MSMBP08118 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MSMBP08118 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MSMBP08118 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MSMBP08118 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
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MSMBP08118 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MSMBP08118 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MSMBP08118 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MSMBP08118 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MSMBP08118 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MSMBP08118 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MSMBP08118 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MSMBP08118 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MSMBP08118 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MSMBP08118 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MSMBP08118 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
MSMBP08118 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MSMBP08118 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MSMBP08118 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MSMBP08118 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MSMBP08118 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MSMBP08118 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MSMBP08118 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MSMBP08118 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MSMBP08118 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MSMBP08118 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MSMBP08118 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MSMBP08118 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MSMBP08118 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MSMBP08118 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MSMBP08118 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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