Protein–RNA interactions for Protein: P02652

APOA2, Apolipoprotein A-II, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA2P02652 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOA2P02652 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOA2P02652 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOA2P02652 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOA2P02652 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOA2P02652 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOA2P02652 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOA2P02652 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOA2P02652 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOA2P02652 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOA2P02652 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOA2P02652 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOA2P02652 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOA2P02652 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOA2P02652 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOA2P02652 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOA2P02652 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOA2P02652 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOA2P02652 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOA2P02652 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOA2P02652 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOA2P02652 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOA2P02652 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOA2P02652 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOA2P02652 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
APOA2P02652 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOA2P02652 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOA2P02652 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOA2P02652 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOA2P02652 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOA2P02652 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOA2P02652 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOA2P02652 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOA2P02652 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOA2P02652 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOA2P02652 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOA2P02652 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOA2P02652 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOA2P02652 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOA2P02652 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOA2P02652 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOA2P02652 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOA2P02652 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOA2P02652 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOA2P02652 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOA2P02652 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOA2P02652 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOA2P02652 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOA2P02652 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOA2P02652 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
APOA2P02652 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOA2P02652 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOA2P02652 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOA2P02652 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOA2P02652 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOA2P02652 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOA2P02652 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOA2P02652 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOA2P02652 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOA2P02652 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOA2P02652 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOA2P02652 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOA2P02652 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOA2P02652 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOA2P02652 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOA2P02652 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOA2P02652 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOA2P02652 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOA2P02652 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOA2P02652 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOA2P02652 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOA2P02652 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOA2P02652 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOA2P02652 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOA2P02652 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOA2P02652 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOA2P02652 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOA2P02652 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOA2P02652 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOA2P02652 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
APOA2P02652 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOA2P02652 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOA2P02652 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOA2P02652 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOA2P02652 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOA2P02652 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOA2P02652 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOA2P02652 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOA2P02652 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOA2P02652 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOA2P02652 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOA2P02652 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOA2P02652 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOA2P02652 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOA2P02652 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOA2P02652 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOA2P02652 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOA2P02652 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOA2P02652 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOA2P02652 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms