Protein–RNA interactions for Protein: P00739

HPR, Haptoglobin-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPRP00739 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HPRP00739 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HPRP00739 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HPRP00739 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HPRP00739 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HPRP00739 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HPRP00739 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HPRP00739 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HPRP00739 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HPRP00739 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HPRP00739 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HPRP00739 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HPRP00739 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HPRP00739 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HPRP00739 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HPRP00739 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HPRP00739 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
HPRP00739 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
HPRP00739 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
HPRP00739 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HPRP00739 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HPRP00739 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HPRP00739 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HPRP00739 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HPRP00739 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HPRP00739 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HPRP00739 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HPRP00739 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HPRP00739 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HPRP00739 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HPRP00739 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
HPRP00739 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HPRP00739 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HPRP00739 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HPRP00739 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HPRP00739 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HPRP00739 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HPRP00739 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HPRP00739 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HPRP00739 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HPRP00739 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HPRP00739 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HPRP00739 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HPRP00739 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
HPRP00739 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HPRP00739 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HPRP00739 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HPRP00739 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HPRP00739 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HPRP00739 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HPRP00739 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HPRP00739 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HPRP00739 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HPRP00739 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HPRP00739 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HPRP00739 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HPRP00739 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HPRP00739 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HPRP00739 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HPRP00739 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HPRP00739 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HPRP00739 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HPRP00739 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HPRP00739 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HPRP00739 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HPRP00739 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HPRP00739 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HPRP00739 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HPRP00739 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HPRP00739 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HPRP00739 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HPRP00739 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HPRP00739 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HPRP00739 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HPRP00739 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HPRP00739 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HPRP00739 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HPRP00739 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HPRP00739 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HPRP00739 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HPRP00739 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HPRP00739 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HPRP00739 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HPRP00739 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HPRP00739 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HPRP00739 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HPRP00739 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HPRP00739 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HPRP00739 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HPRP00739 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HPRP00739 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HPRP00739 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HPRP00739 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HPRP00739 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HPRP00739 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HPRP00739 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HPRP00739 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HPRP00739 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HPRP00739 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HPRP00739 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms