Protein–RNA interactions for Protein: O96028

NSD2, Histone-lysine N-methyltransferase NSD2, humanhuman

Predictions only

Length 1,365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD2O96028 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NSD2O96028 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NSD2O96028 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NSD2O96028 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NSD2O96028 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NSD2O96028 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NSD2O96028 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NSD2O96028 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
NSD2O96028 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NSD2O96028 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NSD2O96028 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
NSD2O96028 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NSD2O96028 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NSD2O96028 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NSD2O96028 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NSD2O96028 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NSD2O96028 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NSD2O96028 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NSD2O96028 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NSD2O96028 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NSD2O96028 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NSD2O96028 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NSD2O96028 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
NSD2O96028 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NSD2O96028 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NSD2O96028 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NSD2O96028 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NSD2O96028 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NSD2O96028 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NSD2O96028 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NSD2O96028 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NSD2O96028 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NSD2O96028 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
NSD2O96028 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NSD2O96028 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NSD2O96028 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NSD2O96028 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NSD2O96028 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NSD2O96028 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NSD2O96028 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
NSD2O96028 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NSD2O96028 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NSD2O96028 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NSD2O96028 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NSD2O96028 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NSD2O96028 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NSD2O96028 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NSD2O96028 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NSD2O96028 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NSD2O96028 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NSD2O96028 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NSD2O96028 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NSD2O96028 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NSD2O96028 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NSD2O96028 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NSD2O96028 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NSD2O96028 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NSD2O96028 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NSD2O96028 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NSD2O96028 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NSD2O96028 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NSD2O96028 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NSD2O96028 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NSD2O96028 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NSD2O96028 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NSD2O96028 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NSD2O96028 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NSD2O96028 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NSD2O96028 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NSD2O96028 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NSD2O96028 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NSD2O96028 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NSD2O96028 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NSD2O96028 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NSD2O96028 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NSD2O96028 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NSD2O96028 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
NSD2O96028 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NSD2O96028 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NSD2O96028 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NSD2O96028 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NSD2O96028 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NSD2O96028 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NSD2O96028 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NSD2O96028 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NSD2O96028 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NSD2O96028 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NSD2O96028 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
NSD2O96028 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NSD2O96028 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NSD2O96028 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NSD2O96028 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NSD2O96028 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NSD2O96028 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NSD2O96028 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NSD2O96028 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NSD2O96028 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NSD2O96028 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NSD2O96028 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NSD2O96028 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms