Protein–RNA interactions for Protein: O95428

PAPLN, Papilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPLNO95428 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PAPLNO95428 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PAPLNO95428 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PAPLNO95428 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PAPLNO95428 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PAPLNO95428 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PAPLNO95428 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PAPLNO95428 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PAPLNO95428 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PAPLNO95428 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PAPLNO95428 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PAPLNO95428 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PAPLNO95428 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PAPLNO95428 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PAPLNO95428 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PAPLNO95428 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PAPLNO95428 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PAPLNO95428 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PAPLNO95428 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PAPLNO95428 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PAPLNO95428 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PAPLNO95428 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PAPLNO95428 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PAPLNO95428 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PAPLNO95428 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PAPLNO95428 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PAPLNO95428 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PAPLNO95428 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PAPLNO95428 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PAPLNO95428 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PAPLNO95428 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PAPLNO95428 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PAPLNO95428 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PAPLNO95428 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PAPLNO95428 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PAPLNO95428 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PAPLNO95428 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PAPLNO95428 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PAPLNO95428 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PAPLNO95428 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PAPLNO95428 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PAPLNO95428 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PAPLNO95428 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PAPLNO95428 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PAPLNO95428 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PAPLNO95428 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PAPLNO95428 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PAPLNO95428 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PAPLNO95428 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PAPLNO95428 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PAPLNO95428 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PAPLNO95428 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PAPLNO95428 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PAPLNO95428 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PAPLNO95428 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PAPLNO95428 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PAPLNO95428 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PAPLNO95428 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PAPLNO95428 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PAPLNO95428 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PAPLNO95428 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PAPLNO95428 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PAPLNO95428 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PAPLNO95428 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PAPLNO95428 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PAPLNO95428 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PAPLNO95428 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PAPLNO95428 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PAPLNO95428 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PAPLNO95428 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PAPLNO95428 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PAPLNO95428 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PAPLNO95428 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PAPLNO95428 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PAPLNO95428 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PAPLNO95428 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PAPLNO95428 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PAPLNO95428 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PAPLNO95428 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PAPLNO95428 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PAPLNO95428 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PAPLNO95428 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PAPLNO95428 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PAPLNO95428 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PAPLNO95428 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PAPLNO95428 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PAPLNO95428 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PAPLNO95428 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PAPLNO95428 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PAPLNO95428 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PAPLNO95428 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PAPLNO95428 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PAPLNO95428 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PAPLNO95428 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PAPLNO95428 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PAPLNO95428 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PAPLNO95428 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PAPLNO95428 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PAPLNO95428 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PAPLNO95428 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms