Protein–RNA interactions for Protein: O94817

ATG12, Ubiquitin-like protein ATG12, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG12O94817 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG12O94817 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG12O94817 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG12O94817 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG12O94817 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG12O94817 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG12O94817 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG12O94817 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG12O94817 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG12O94817 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG12O94817 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG12O94817 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG12O94817 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG12O94817 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG12O94817 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG12O94817 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG12O94817 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG12O94817 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG12O94817 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG12O94817 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG12O94817 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG12O94817 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG12O94817 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG12O94817 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG12O94817 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG12O94817 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG12O94817 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG12O94817 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG12O94817 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG12O94817 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG12O94817 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG12O94817 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG12O94817 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG12O94817 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG12O94817 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG12O94817 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG12O94817 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG12O94817 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG12O94817 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG12O94817 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG12O94817 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG12O94817 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG12O94817 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG12O94817 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG12O94817 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG12O94817 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG12O94817 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG12O94817 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG12O94817 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG12O94817 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG12O94817 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG12O94817 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG12O94817 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG12O94817 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG12O94817 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG12O94817 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG12O94817 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG12O94817 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG12O94817 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG12O94817 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG12O94817 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG12O94817 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG12O94817 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG12O94817 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG12O94817 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG12O94817 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG12O94817 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG12O94817 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG12O94817 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG12O94817 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG12O94817 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG12O94817 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG12O94817 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG12O94817 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG12O94817 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG12O94817 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG12O94817 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG12O94817 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG12O94817 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG12O94817 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG12O94817 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG12O94817 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG12O94817 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG12O94817 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG12O94817 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG12O94817 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG12O94817 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG12O94817 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG12O94817 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG12O94817 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG12O94817 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG12O94817 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG12O94817 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG12O94817 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG12O94817 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG12O94817 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG12O94817 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG12O94817 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG12O94817 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG12O94817 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms