Protein–RNA interactions for Protein: O75909

CCNK, Cyclin-K, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNKO75909 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCNKO75909 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCNKO75909 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCNKO75909 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCNKO75909 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCNKO75909 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCNKO75909 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCNKO75909 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCNKO75909 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCNKO75909 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCNKO75909 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCNKO75909 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCNKO75909 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCNKO75909 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
CCNKO75909 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCNKO75909 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCNKO75909 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCNKO75909 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCNKO75909 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCNKO75909 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCNKO75909 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCNKO75909 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCNKO75909 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCNKO75909 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCNKO75909 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCNKO75909 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCNKO75909 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCNKO75909 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCNKO75909 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCNKO75909 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCNKO75909 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCNKO75909 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCNKO75909 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCNKO75909 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCNKO75909 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCNKO75909 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCNKO75909 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCNKO75909 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCNKO75909 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCNKO75909 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCNKO75909 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCNKO75909 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCNKO75909 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCNKO75909 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCNKO75909 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCNKO75909 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCNKO75909 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCNKO75909 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCNKO75909 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CCNKO75909 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCNKO75909 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCNKO75909 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCNKO75909 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCNKO75909 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCNKO75909 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCNKO75909 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCNKO75909 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCNKO75909 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCNKO75909 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCNKO75909 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCNKO75909 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCNKO75909 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCNKO75909 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCNKO75909 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCNKO75909 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCNKO75909 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCNKO75909 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCNKO75909 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCNKO75909 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCNKO75909 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCNKO75909 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCNKO75909 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCNKO75909 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCNKO75909 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCNKO75909 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCNKO75909 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CCNKO75909 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCNKO75909 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCNKO75909 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCNKO75909 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCNKO75909 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCNKO75909 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCNKO75909 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCNKO75909 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCNKO75909 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCNKO75909 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCNKO75909 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCNKO75909 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCNKO75909 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCNKO75909 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCNKO75909 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCNKO75909 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCNKO75909 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCNKO75909 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCNKO75909 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCNKO75909 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCNKO75909 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCNKO75909 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCNKO75909 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCNKO75909 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms