Protein–RNA interactions for Protein: O60232

SSSCA1, Sjoegren syndrome/scleroderma autoantigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSSCA1O60232 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SSSCA1O60232 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSSCA1O60232 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSSCA1O60232 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SSSCA1O60232 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSSCA1O60232 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SSSCA1O60232 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSSCA1O60232 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSSCA1O60232 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSSCA1O60232 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SSSCA1O60232 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SSSCA1O60232 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SSSCA1O60232 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SSSCA1O60232 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSSCA1O60232 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SSSCA1O60232 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SSSCA1O60232 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSSCA1O60232 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SSSCA1O60232 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSSCA1O60232 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSSCA1O60232 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SSSCA1O60232 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SSSCA1O60232 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSSCA1O60232 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSSCA1O60232 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSSCA1O60232 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSSCA1O60232 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSSCA1O60232 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSSCA1O60232 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSSCA1O60232 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSSCA1O60232 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSSCA1O60232 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSSCA1O60232 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSSCA1O60232 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSSCA1O60232 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSSCA1O60232 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSSCA1O60232 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSSCA1O60232 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSSCA1O60232 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSSCA1O60232 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSSCA1O60232 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSSCA1O60232 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSSCA1O60232 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSSCA1O60232 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSSCA1O60232 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SSSCA1O60232 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSSCA1O60232 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSSCA1O60232 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSSCA1O60232 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSSCA1O60232 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSSCA1O60232 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSSCA1O60232 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSSCA1O60232 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSSCA1O60232 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSSCA1O60232 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSSCA1O60232 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSSCA1O60232 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSSCA1O60232 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSSCA1O60232 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSSCA1O60232 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSSCA1O60232 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSSCA1O60232 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSSCA1O60232 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSSCA1O60232 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSSCA1O60232 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSSCA1O60232 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSSCA1O60232 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSSCA1O60232 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSSCA1O60232 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSSCA1O60232 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSSCA1O60232 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSSCA1O60232 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSSCA1O60232 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSSCA1O60232 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSSCA1O60232 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SSSCA1O60232 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSSCA1O60232 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSSCA1O60232 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSSCA1O60232 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSSCA1O60232 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SSSCA1O60232 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SSSCA1O60232 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSSCA1O60232 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSSCA1O60232 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSSCA1O60232 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSSCA1O60232 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSSCA1O60232 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSSCA1O60232 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSSCA1O60232 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSSCA1O60232 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSSCA1O60232 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSSCA1O60232 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSSCA1O60232 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSSCA1O60232 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSSCA1O60232 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSSCA1O60232 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSSCA1O60232 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSSCA1O60232 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSSCA1O60232 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSSCA1O60232 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms